Эмблема Scorpi Turk Venom

UV-Vis: почему белки измеряют при 280 nm?

Кратко изложить с помощью ИИ

Прослушать материал

0:007:23
UV-Vis: почему белки измеряют при 280 nm?

UV-Vis-спектрофотометрия измеряет, насколько сильно раствор поглощает свет разных длин волн. В статье объясняются принцип метода, причины выбора 280 нанометров для измерения белка, чтение спектра сканирования, смысл результата, зарегистрированного для референсной партии, и ограничения метода. Значения измеряются в независимой лаборатории вне предприятия и могут различаться от партии к партии.

Один из самых быстрых способов понять, что находится в растворе, — направить на него свет и посмотреть, сколько его пройдёт. UV-Vis-спектрофотометрия выражает эту простую идею в числах: свет ультрафиолетовой и видимой области пропускают через образец и сравнивают интенсивность на входе и на выходе.

Основные узлы прибора — источник света, устройство выбора длины волны, кювета с образцом и детектор, измеряющий прошедший свет. Перед измерением необходимо измерить один растворитель, то есть снять холостое показание; тогда полученное значение отражает только вклад растворённого вещества.

Выбор кюветы тоже напрямую влияет на результат. Обычные пластиковые и стеклянные кюветы сами поглощают в ультрафиолетовой области и искажают показание при 280 нанометрах; в этой области используют кварцевые кюветы. Чистые окна кюветы, отсутствие пузырьков воздуха в растворе и свободный оптический путь — основные условия измерения.

От чего зависит поглощение?

Поглощение изменяется в зависимости от трёх факторов: способности вещества поглощать на данной длине волны, концентрации в растворе и длины пути, который свет проходит в образце. Линейная зависимость между ними — основа спектрофотометрического измерения; длина оптического пути в стандартных кюветах постоянна.

У линейности есть рабочий диапазон. В очень концентрированных растворах до детектора доходит слишком мало света, и измерение теряет надёжность; в очень разбавленных сигнал теряется в шуме. Поэтому образец разводят так, чтобы попасть в надёжный диапазон прибора, и учитывают коэффициент разведения.

Сам прибор тоже готовят к измерению. Лампа должна прогреться, базовая линия — быть ровной, а точность установки длины волны — регулярно проверяться. Если базовая линия дрейфует, показание несёт вклад не образца, а прибора.

Почему 280 нанометров?

Три аминокислоты, входящие в белковые и пептидные цепи, заметно поглощают в ультрафиолетовой области: триптофан, тирозин и, слабее, фенилаланин. Кольцевая структура этих остатков даёт максимум поглощения около 280 нанометров. Поэтому значение, измеренное в растворе на этой длине волны, служит практическим показателем присутствия белка.

Вторая причина выбора — селективность. Сама пептидная связь очень сильно поглощает около 200 нанометров, но в этой области поглощают и буферы, и растворители, поэтому измерение сопровождается сильным шумом. 280 нанометров — компромисс, при котором сигнал белка хорошо читается, а вклад среды остаётся относительно низким.

Длина волныПоглощающая структураПрактическое замечание
~200 nmПептидная связьОчень чувствительно, но велик вклад растворителя и буфера
~260 nmНуклеиновые кислотыОтслеживается как показатель загрязнения образца нуклеиновыми кислотами
~280 nmТриптофан и тирозинОбычный выбор для измерения белка
320 nm и вышеЗаметного поглощения не ожидаетсяПодъём считается признаком мутности или агрегации

Одновременное измерение на второй длине волны усиливает интерпретацию. Нуклеиновые кислоты сильно поглощают около 260 нанометров; отношение двух значений позволяет судить, есть ли в образце вклад нуклеиновых кислот. Для материала с преобладанием пептидов, такого как яд, это отношение можно отслеживать как вспомогательный критерий чистоты пробоподготовки.

Что показывает спектр сканирования?

Если вместо измерения на одной длине волны просканировать широкий диапазон, результат получается в виде кривой. Её форма говорит больше, чем одно число: видно, где именно находится максимум, насколько ровна область вне пика и нет ли подъёма в сторону длинных волн. Неожиданный подъём в длинноволновой области обычно указывает на нерастворённые частицы или агрегацию.

При сканировании референсной партии нашего предприятия был измерен диапазон от 190 до 400 нанометров, а максимум зарегистрирован при 280 нанометрах. Измерение выполнено на спектрофотометре Shimadzu UV-1900i в независимой лаборатории вне предприятия. Результат согласуется с тем, что образец состоит из компонентов, содержащих ароматические аминокислоты.

Для воспроизводимости измерения фиксируют и то, как подготовлен образец: растворитель, коэффициент разведения, время растворения и температуру измерения. При измерении одного и того же образца в разных разведениях значения должны согласовываться с коэффициентом разведения; несоответствие чаще всего указывает на неполное растворение или агрегацию, и измерение повторяют.

В отличие от большинства методов, сканирование не расходует образец. Раствор из кюветы после измерения можно забрать и продолжить на том же образце другие анализы. Для материала, количество которого ограничено, это практическое преимущество, ставящее метод в начало последовательности анализов.

По той же причине спектрофотометрическое измерение используют и как первый шаг контроля при приёмке партии. Если ожидаемый пик не на своём месте или форма кривой необычна, пробоподготовку проверяют ещё раз, прежде чем переходить к следующим анализам.

Чего метод не говорит?

Значение при 280 нанометрах быстро говорит о присутствии белка, но не даёт сведений об идентичности. Какие белки присутствуют, на сколько компонентов они распределены или какова их молекулярная масса — из этого измерения установить невозможно. Кроме того, пептид с низким содержанием ароматических остатков может дать более слабый сигнал, чем ожидается при его реальном количестве.

Поэтому спектрофотометрию используют не изолированно, а как первое звено цепочки анализов. Число компонентов определяют разделением методом хроматографии; подробности — в статье о ВЭЖХ (HPLC). Для распределения масс применяют электрофорез. Численное значение концентрации требует калибровки; построение калибровочной кривой рассматривается в статье об определении белка.

Главное достоинство метода — скорость: за несколько минут и без расходования образца он даёт первичную оценку. Результаты измерений по нашим партиям публикуются на странице анализа; для каждой партии значения измеряются заново.

  • UV-Vis
  • спектрофотометрия
  • 280 nm
  • измерение белка

Часто задаваемые вопросы

Остатки триптофана и тирозина заметно поглощают около этой длины волны. 280 нанометров — компромисс, при котором сигнал белка хорошо читается, а шум от буфера остаётся относительно низким.

Измерение даёт значение поглощения; для перехода к численной концентрации нужна калибровка по известным концентрациям. Кроме того, пептиды с небольшим числом ароматических остатков могут давать более слабый сигнал, чем ожидается.

При 320 нанометрах и выше заметного поглощения не ожидается. Подъём в этой области обычно расценивают как признак нерастворённых частиц или агрегации, и он требует проверки пробоподготовки.

Статья носит информационный характер. Поставляемый нативный яд предназначен только для научных исследований и промышленного применения; он не применяется непосредственно на людях или животных.

Методы анализа

Статьи по теме